הנקבוביות המתפתחת במשקע לאחר שקיעתו הראשונית כתוצאה משינויים כימיים, ביולוגיים וסדימנטוריים (קבורה מתחת לשכבות החדשות יותר); צורת הנקבוביות הראשוניות בהשוואה לנקבוביות המשניות. הנקבוביות הנובעת משינויים טקטוניים בסלע (fracture porosity) איננה מסווגת כנקבוביות דיאגנטית.