המשימה החשובה ביותר שעומדת בפני משרד האנרגיה היא להגביר את ביטחון האנרגיה של ארה”ב תוך תמיכה בחידושים מדעיים וטכנולוגיים התורמים למשימה זו ושמירה על איכות הסביבה באמצעות מנגנוני בקרה על השלכת פסולת גרעינית.