תהליך זיקוק החומר שעבר זיקוק ראשוני. אפשר לייחס מגדל זיקוק חוזר ליחידת זיקוק נפט גולמי המפיקה נפטא בעלת טווח רחב של נקודות רתיחה כתוצר זיקוק חוזר. בהיותו מתקן להפרדת נפטא קלה וכבדה ממרכיב נפט בעל טווח רתיחה רחב, מגדל זיקוק חוזר מהווה למעשה את המשך פעילותו של מגדל זיקוק נפט גולמי.